В аспирантуру ИСАА принимаются лица, имеющие диплом специалиста или диплом магистра. Студенты, которые проявили во время учёбы в институте склонность к научным исследованиям и имели хорошую успеваемость, получают рекомендацию Учёного совета института к поступлению в аспирантуру. Обучение в аспирантуре проводится по следующим программам подготовки научно-педагогических кадров. Учёба в аспирантуре является подготовкой к соискательству ученoй степени кандидата наук. После получения учёной степени кандидата наук лица, продемонстрировавшие исключительные результаты в научно-исследовательской деятельности, могут продолжить учёбу в докторантуре.