Разработка и реализация образовательных и научных программ осуществляется на базе соглашений о сотрудничестве общеуниверситетского и межфакультетского уровней. На данный момент подписано более 50 международных договоров о сотрудничестве, рабочих программ и меморандумов о взаимопонимании между ИСАА МГУ и ведущими зарубежными иностранными университетами, научными центрами и институтами, международными организациями и ассоциациями. В рамках международных соглашений регулярно проводятся научные конференции, круглые столы, мастер-классы, воркшопы и семинары.
Список зарубежных партнеров ИСАА МГУ
| 1. | Армения | Ереванский гуманитарный институт |
| 2. | Вьетнам | Ханойский государственный университет (Институт социальных и гуманитарных наук) |
| 3. | Германия | Франкфуртский университет имени Иоганна Вольфганга Гете (Институт африканских языков) |
| 4. | Грузия | Тбилисский институт стран Азии и Африки |
| 5. | Израиль | БФ ПРЕКО |
| 6. | Израиль | Еврейское агентство Израиля (Сохнут) |
| 7. | Индия | Мадрасский университет (Факультет тамильской литературы) |
| 8. | Индия | Центральный университет английского и иностранных языков |
| 9. | Индонезия | Университет Индонезии |
| 10. | Иран | Культурное представительство при Посольстве Исламской Республики Иран в РФ |
| 11. | Иран | Организация изучения и создания учебных книг по гуманитарным наукам (САМТ) |
| 12. | Иран | Университет Алламех Табатабаи (Факультет политических наук и юриспруденции) |
| 13. | Кения | Университет Мои |
| 14. | КНР | Педагогический университет Ханчжоу |
| 15. | КНР | Педагогический университет Шанси (Факультет иностранных языков) |
| 16. | КНР | Пекинский университет (Департамент международных отношений) |
| 17. | КНР | Сeверо-восточный нормальный университет |
| 18. | КНР | Хайнаньский университет (Факультет Санья) |
| 19. | КНР | Чжэцзянский университет |
| 20. | КНР | Шэньчженский политехнический университет |
| 21. | Малайзия | Научный университет Малайзии |
| 22. | Малайзия | Педагогический университет имени Султана Идриса |
| 23. | Марокко | Рабатский университет Мохаммеда V |
| 24. | Мьянма | Янгонский университет иностранных языков |
| 25. | Пакистан | Центр Южно-азиатских исследований Университета Пенджаб |
| 26. | Польша | Варшавский университет (Исторический факультет) |
| 27. | Республика Корея | Пусанский национальный университет (Гуманитарный факультет) |
| 28. | Республика Корея | Университет Конкук |
| 29. | Республика Корея | Университет Намсеул |
| 30. | Республика Корея | Университет Сеула |
| 31. | Саудовская Аравия | Отделение исламоведения под патронажем Его Королевского Высочества эмира Наиф Абель Азиз Ааль Сауд |
| 32. | Таиланд | Университет Тхаммасат |
| 33. | Таиланд | Университет Рамкхамхенга |
| 34. | Таиланд | Университет Касем Бундит |
| 35. | Тайвань | Институт России при Тамканском университете |
| 36. | Тайвань | Отдел образования Представительства Тайбэйско-Московской Координационной комиссии по экономическому и культурному сотрудничеству |
| 37. | Танзания | Открытый университет Танзании |
| 38. | Тунис | Тунисский университет (Высший институт языков) |
| 39. | Тунис | Европейский университет Туниса |
| 40. | Турция | Анкарский университет |
| 41. | Турция | Университет Едитепе |
| 42. | Узбекистан | Ташкентский государственный институт востоковедения |
| 43. | Филиппины | Университет Филиппин Дилиман |
| 44. | Филиппины | Университет Атенео-де-Манила |
| 45. | Франция | Научно-исследовательский институт арабо-мусульманского мира (Национальный центр научных исследований, Университеты Экс-ан-Прованса-Марселя I и III) |
| 46. | Франция | Университет Прованс-Экс-Марсель I |
| 47. | Эфиопия | Университет Адис-Абебы |
| 48. | Япония | Общество дружбы с Россией при Молодежной палате Японии |
| 49. | Япония | Университет Аояма Гакуин |
| 50. | Япония | Университет Васэда |
| 51. | Япония | Университет Рюкоку |
| 52. | Япония | Университет Сока |
| 53. | Япония | Университет Хосэй |
| 54. | Япония | Японский фонд при Посольстве Японии в РФ |